针对您提出的“公司申请破产没钱赔偿违约金怎么算”这一问题，我将为您详细解答。

当公司申请破产时，违约金的赔偿确实需要遵循一定的法定程序。首先，违约金在破产清算中被视为普通破产债权。这意味着，在破产财产分配的过程中，违约金债权与其他普通债权享有同等的地位，但清偿顺序位于破产费用、共益债务、职工工资、社保费用和税款之后。

具体来说，债权人（如您提到的案例中的小李）需要在规定的债权申报期限内向破产管理人申报违约金债权。在申报时，债权人需要明确说明违约金的数额、是否存在财产担保，并提供相应的证据来支持其债权主张。

破产管理人在收到债权申报后，会进行审查确认。一旦债权被确认，破产财产将首先用于支付破产费用和共益债务。之后，会按照顺序清偿职工工资、社保费用和税款。只有在这些费用全部清偿完毕后，才会轮到普通破产债权（包括违约金债权）的清偿。

如果破产财产足够清偿所有普通破产债权，那么您的违约金将按照申报的金额全额赔偿。然而，如果破产财产不足以清偿所有普通破产债权，那么各普通债权将按照比例进行受偿。这意味着，您可能无法获得全额的违约金赔偿，而是只能获得一部分。

此外，对于其他债权人可能提出的违约金过高的争议，这需要根据相关证据和法律规定进行进一步判断。如果违约金确实过高，且不符合法律规定或合同约定，那么管理人或法院可能会对违约金数额进行调整。

综上所述，当公司申请破产时，违约金的赔偿需要遵循法定程序，并受到破产财产分配顺序的限制。如果破产财产不足以清偿所有普通破产债权，那么您可能只能获得一部分的违约金赔偿。希望这个解答能够帮助您更好地理解公司破产时违约金的赔偿问题。