产品制造企业查其代理商给客户开的发票是否合法，这一行为本身并不直接构成违法，但需注意行为的方式和界限，以免侵犯代理商或客户的合法权益。以下是从不同角度对这一问题的分析：

1. 从合同关系与代理权限角度：

   • 产品制造企业与代理商之间通常存在代理合同关系，代理商在合同约定的范围内代表制造企业进行销售活动，并开具相应的发票。制造企业有权监督代理商的销售行为，包括发票的开具情况，以确保其符合合同约定和法律法规的要求。
   • 然而，制造企业在查验发票时，应遵循合同约定的方式和程序，不得擅自超越代理权限或侵犯代理商的合法权益。例如，制造企业不应直接要求客户提供代理商开具的发票进行查验，除非合同中有明确约定或客户同意。

2. 从法律法规与税务合规角度：

   • 发票的开具和管理受到相关法律法规的严格规范。代理商在开具发票时，必须遵守税法规定，确保发票的真实性、合法性和准确性。制造企业查验发票的合法性，实际上是在监督代理商是否遵守了这些法律法规。
   • 但制造企业在查验过程中，应注意不得侵犯代理商或客户的隐私权、商业秘密等合法权益。例如，制造企业不应要求代理商提供与其销售活动无关的敏感信息，或利用查验发票的机会进行不正当竞争。

3. 从实际操作与风险防范角度：

   • 在实际操作中，制造企业可以通过与代理商建立定期的沟通机制、要求代理商提供发票复印件或电子数据等方式进行查验。这些方式既符合法律法规的要求，又能有效监督代理商的销售行为。
   • 同时，制造企业应加强内部管理，完善发票查验流程和制度，确保查验行为的合法性和合规性。例如，可以制定明确的发票查验标准、查验周期和查验责任人等。

4. 可能存在的法律后果：

   • 如果制造企业在查验发票过程中违反了法律法规或合同约定，可能会面临法律责任和风险。例如，如果制造企业擅自要求客户提供代理商开具的发票进行查验，并因此侵犯了客户的隐私权或商业秘密，可能会承担相应的民事赔偿责任。
   • 因此，制造企业在查验发票时应谨慎行事，确保其行为符合法律法规和合同约定的要求。

综上所述，产品制造企业查其代理商给客户开的发票是否合法，需根据具体情况进行判断。在查验过程中，制造企业应遵循合同约定和法律法规的要求，确保查验行为的合法性和合规性。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。