迟到已扣除工资后，仍有可能作为辞退的依据，但需符合法定条件和遵循法定程序。以下从不同角度进行分析：

1. 规章制度明确规定：

   • 如果用人单位的规章制度里明确规定，当迟到达到一定次数或者严重程度时，公司可以辞退员工，并且这个规定的制定程序是合法的，也已经向员工进行了公示。那么，当员工迟到的情况严重违反了这一规定时，公司辞退员工的行为可能是合法的。例如，公司规章制度明确规定，一个月内累计迟到五次及以上属于严重违反公司规章制度，且该制度制定程序合法并已向员工公示。员工在一个月内累计迟到六次，达到了严重违反规章制度的程度，公司依据该规章制度辞退员工，无需支付经济补偿。

2. 迟到行为对工作造成重大不利影响：

   • 即使员工迟到未达到严重违反规章制度的程度，若用人单位有充分证据证明迟到行为对工作造成重大不利影响，如导致关键业务延误等，基于劳动合同法中关于用人单位因客观情况发生重大变化，致使劳动合同无法履行的规定，在与员工协商变更劳动合同不成的情况下，也可以依法解除劳动合同，但需支付相应经济补偿。

3. 偶尔迟到被辞退的处理：

   • 通常，员工偶尔迟到一次就被扣钱，公司直接将其辞退是缺乏合理依据的。此时，员工可以先和公司沟通，了解公司辞退自己的原因和依据。要是员工觉得公司的辞退行为不合法，就需要收集相关证据，像考勤记录、工资条、和领导的沟通记录等，然后申请劳动仲裁，以此要求恢复劳动关系或者获得相应的经济赔偿。

在实际操作中，用人单位必须依法依规行事，避免违法解除劳动合同引发法律风险。对于员工而言，如果认为公司的辞退行为不合法，应及时收集证据并申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。

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