在虚开增值税发票案件中，公安机关查到嫌疑人的银行卡有转账流水，这一信息虽然对案件调查具有重要价值，但仅凭转账流水并不能直接定罪。以下是对此问题的详细解答：

首先，要明确的是，定罪是一个严谨的法律过程，需要依据充分的证据，并且这些证据必须经过法定的程序进行核实和确认。根据《刑事诉讼法》的相关规定，对一切案件的判处都要重证据，重调查研究，不轻信口供。只有被告人供述，没有其他证据的，不能认定被告人有罪和处以刑罚。

其次，银行转账流水虽然可以作为案件调查的重要线索和证据之一，但它并不能单独作为定罪的依据。因为银行流水只能反映资金的往来情况，如资金的流入流出时间、金额等，而无法直接证明这些资金往来与虚开增值税发票的犯罪行为有直接关系。

为了准确判定罪名，公安机关还需要结合其他证据进行综合判断。这些证据可能包括但不限于：虚开的增值税发票本身、相关的会计账簿和记账凭证、嫌疑人的供述和辩解、其他证人的证言、以及可能存在的其他物证或电子数据等。所有这些证据都需要经过严格的法定程序进行核实和确认，以确保其真实性和可靠性。

最后，只有当所有证据都相互印证，形成完整的证据链条，并且能够排除所有合理的怀疑时，才能准确地判定罪名。因此，在虚开增值税发票案件中，公安机关查到嫌疑人的银行卡有转账流水只是案件调查的一部分，并不能直接作为定罪的依据。

综上所述，仅凭银行转账流水并不能直接定罪，而是需要结合其他证据进行综合判断和分析。如果您或您身边的人面临类似的问题，建议尽快咨询专业的法律人士以获取准确的法律意见和帮助。