关于公司履约保证金不退并需要开具违约金发票的问题，我们可以从以下几个方面来详细解答：

首先，我们需要明确的是，履约保证金和违约金是两个不同的概念。履约保证金是为了确保合同双方按约履行而缴纳的一笔款项，而违约金则是在合同一方违约时，按照合同约定需要向另一方支付的一定金额的赔偿。

当公司决定不退还履约保证金，并将其作为违约金处理时，是否需要开具发票，这主要取决于当初收取履约保证金时是否已经开具了发票。

1. 已开具发票的情况：

   • 如果公司在收取履约保证金时已经开具了发票，那么在不退还并转为违约金的情况下，通常需要按照发票管理的相关规定开具红字发票（也称为负数发票）进行冲减。
   • 红字发票的开具是为了在税务上反映业务的真实情况，确保已开具发票的款项与实际业务相符。
   • 通过开具红字发票，公司可以在税务上正确处理这笔款项，避免税务风险。

2. 未开具发票的情况：

   • 如果公司在收取履约保证金时并未开具发票，那么在决定不退还并作为违约金处理时，一般不需要再开具发票。
   • 但这种情况下，公司必须在财务账目上明确记录该笔履约保证金的收取、未退还以及转为违约金的情况。
   • 同时，为了证明不退还保证金的合理性和依据，公司应向对方提供书面的违约说明或相关协议等文件。

综上所述，处理公司履约保证金不退并需要开具违约金发票的问题时，公司应根据具体情况判断是否需要开具发票，并确保在财务和税务上都得到妥善处理。如果对此类问题存在疑问或不确定如何处理，建议咨询专业的财务或税务顾问，以确保公司的合规运营。