企业帮忙代扣专项扣除税费是合法的。但前提是，这种代扣行为必须基于法律的规定和员工的同意，且需要确保操作的准确性和合规性。

详细分析：

1. 法律依据：

   • 根据税法相关规定，企业有义务为员工代扣代缴个人所得税等税费。这包括基于员工提供的专项扣除信息，进行相应的税前扣除。

2. 员工同意：

   • 企业在进行代扣操作前，通常需要员工提供相关的专项扣除信息，如子女教育、继续教育、大病医疗等支出情况。员工应确保所提供信息的真实性，并同意企业进行代扣。

3. 准确性和合规性：

   • 企业在代扣过程中，必须确保所扣金额的准确性，避免多扣或少扣。同时，企业还需要遵守税法等相关法律法规，确保代扣行为的合规性。

4. 责任与义务：

   • 企业作为代扣代缴义务人，有责任确保代扣过程的合法性和准确性。如果因企业操作不当导致员工权益受损，企业可能需要承担相应的法律责任。

实际操作建议：

• 企业在代扣专项扣除税费前，应建立完善的代扣制度，明确代扣的范围、标准和流程。
• 企业应加强对员工的税法知识培训，提高员工的税法意识和合规意识。
• 企业应定期与税务部门进行沟通，及时了解税法政策的变化，确保代扣行为的合规性。

综上所述，企业帮忙代扣专项扣除税费是合法的，但前提是必须基于法律的规定和员工的同意，并确保操作的准确性和合规性。如果您在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。