针对您提出的问题“施工合同因违法转包无效，该合同约定以业主、监理确认的工程量办理费用结算的条款是否有效”，以下是我的详细解答：

首先，我们需要明确的是，施工合同因违法转包而被认定为无效，这是基于《合同法》、《建筑法》以及《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释》等相关法律法规的明确规定。在这些法律法规中，明确禁止了承包人非法转包的行为，并规定此类行为无效。

接下来，我们分析合同中关于“以业主、监理确认的工程量办理费用结算”的条款。这一条款本身是合同中关于工程款结算的约定，其有效性原则上应受合同整体有效性的影响。然而，在合同因违法转包而无效的情况下，我们需要特别考虑这一条款的独立性。

根据《合同法》的相关规定，合同无效后，合同中的结算和清理条款仍然可能具有效力，这取决于这些条款是否具有相对独立性，并且不依赖于合同的其他无效部分。在这个案例中，“以业主、监理确认的工程量办理费用结算”的条款可能被视为一个相对独立的结算条款。

现在，我们根据具体情况来讨论这一条款的适用性：

1. 工程已竣工并验收合格：

   • 如果工程已经竣工并通过了验收，那么根据相关法律法规和司法解释，即使合同无效，承包人也有权要求参照合同约定支付工程价款。在这种情况下，“以业主、监理确认的工程量办理费用结算”的条款应当得到尊重和执行。

2. 工程未竣工或未验收合格：

   • 如果工程未竣工或未通过验收，那么情况会相对复杂。此时，承包人可能无法直接依据原合同中的结算条款要求支付工程款。但是，如果当事人之间能够就工程款结算达成协议，或者法院认为按照定额据实结算对承包人不公而参照合同约定支付，那么这一条款仍然可能作为结算的依据。

综上所述，尽管施工合同因违法转包而无效，但其中关于“以业主、监理确认的工程量办理费用结算”的条款在特定情况下仍然可能具有效力。这取决于工程的具体状况、当事人的行为以及法院的判断。因此，在实际操作中，建议当事人咨询专业律师或法律机构，以获取更具体、更准确的法律意见。