签了补偿金协议后，在离职证明中不可以随意填写为“自离”。以下是详细分析：

法律背景

1. 补偿金协议的性质：补偿金协议通常是用人单位与员工在解除劳动关系时，就经济补偿等事项达成的一致意见。它具有法律效力，双方均应遵守。
2. 离职证明的作用：离职证明是用人单位为员工出具的，证明员工离职时间、离职原因、工作岗位等信息的文件。它对于员工后续就业、办理社保等事务具有重要作用。

法律分析

1. 离职原因的准确性：离职证明中的离职原因应如实反映员工的离职情况。如果员工是依据补偿金协议离职，那么离职原因应与之相符，如“协商一致解除劳动关系”或“按补偿金协议离职”等。
2. “自离”的含义及后果：“自离”通常指员工未经用人单位同意或未履行相关手续而擅自离职。这种离职方式往往被视为违纪行为，可能会影响员工的后续就业和声誉。
3. 法律责任的承担：如果用人单位在离职证明中虚假填写离职原因，如将依据补偿金协议离职的员工填写为“自离”，那么用人单位可能面临法律责任。员工有权要求用人单位更正离职证明，甚至可以通过法律途径维护自己的合法权益。

法律建议

1. 如实填写离职证明：用人单位在出具离职证明时，应如实填写员工的离职原因，确保离职证明的准确性和真实性。
2. 协商解决争议：如果员工与用人单位在离职原因上存在争议，双方应通过协商或法律途径解决，而不是在离职证明上随意填写。
3. 保留证据：员工应妥善保管补偿金协议、离职证明等文件，以备后续使用。如果用人单位出具了虚假的离职证明，员工可以凭借这些证据维护自己的合法权益。

综上所述，签了补偿金协议后，在离职证明中不可以填写为“自离”。用人单位应如实填写离职证明，确保员工的合法权益不受侵害。如果员工在离职过程中遇到任何问题，可以直接向我咨询，我将为你提供专业的法律帮助。