交通运输局立案后撤案的具体流程和条件，主要取决于案件的性质（民事或刑事）以及相关的法律规定。以下是对不同情况下撤案流程的详细解答：

一、民事案件撤案流程

对于交通事故中的民事赔偿案件，如果双方当事人达成了和解协议，并且已经履行完毕或者双方同意不再追究民事责任，那么可以向法院申请撤诉。

1. 提交撤诉申请：原告需要向法院提交书面的撤诉申请，说明撤诉的原因以及双方和解的情况等。
2. 法院审查：法院会对撤诉申请进行审查，确认没有出现违反法律规定的情况，如躲避法律义务、故意恶意地拖延诉讼等。
3. 裁定准许撤诉：如果法院审查认为撤诉申请符合法律规定，不损害国家、集体和他人的合法权益，会裁定准许撤诉，案件即告结束。

二、刑事案件撤案流程

对于交通肇事等刑事立案，撤案的情况相对复杂，需要满足特定的法定情形。

1. 情节显著轻微、危害不大：如果犯罪情节显著轻微，危害不大，不认为是犯罪的，公安机关可以撤案。例如，轻微的剐蹭事故，双方已达成和解并履行赔偿，且对公共安全等未造成实质危害。
2. 犯罪已过追诉时效期限：交通犯罪有相应的追诉时效，如果案件发生后超过规定时效，且在此期间未启动侦查等法律程序，可以撤案。
3. 经特赦令免除刑罚：如果国家发布特赦令，涵盖该交通案件相关罪名，可以撤案。
4. 犯罪嫌疑人、被告人死亡：因责任主体不存在，案件无法继续推进，可以撤案。

需要注意的是，对于一些已经构成犯罪的交通案件，即使双方达成了民事赔偿谅解，也不必然导致刑事撤案。因为刑事犯罪侵害的是社会公共利益，公诉机关可能仍会依法提起公诉。

三、总结与建议

1. 了解案件性质：首先明确案件是民事还是刑事性质，因为这将决定撤案的具体流程和条件。
2. 咨询专业人士：如果不确定如何撤案或者是否符合撤案条件，建议咨询专业的法律人士或律师以获取准确的法律意见。
3. 准备必要材料：根据案件性质准备相应的撤案材料，如撤诉申请、和解协议等。
4. 遵循法律程序：按照法律规定的程序进行撤案操作，确保合法合规。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时咨询。