合伙协议作废后，其补充协议并不一定会同时作废。这主要取决于补充协议的具体内容、性质以及与原合伙协议的关系。以下是对此问题的详细分析：

一. 补充协议的性质与效力

1. 补充协议的定义：补充协议是对原合同的补充或变更，它通常在原合同基础上对某些条款进行修改、增加或解释。

2. 补充协议的效力：补充协议具有法律效力，但前提是必须满足一些条件，如双方自愿、平等，不违反法律法规和公共利益，不违反原合同条款的核心内容等。

二. 合伙协议作废对补充协议的影响

1. 补充协议的独立性：补充协议虽然依附于原合伙协议，但在某些情况下，它可能具有相对独立性。例如，如果补充协议的内容可以独立履行，且不与原合伙协议的核心内容相冲突，那么即使原合伙协议作废，补充协议也可能仍然有效。

2. 特殊情况：

   • 如果补充协议明确规定了即使原合伙协议作废，其某些条款或全部条款仍然有效，那么这些条款将不受原合伙协议作废的影响。

   • 如果补充协议的内容涉及结算和清理条款，根据《民法典》的相关规定，合同的权利义务关系终止不影响合同中结算和清理条款的效力。因此，在这种情况下，即使原合伙协议作废，补充协议中的结算和清理条款仍然有效。

三. 结论与建议

1. 结论：合伙协议作废后，其补充协议并不一定会同时作废。这需要根据补充协议的具体内容、性质以及与原合伙协议的关系来判断。

2. 建议：在处理此类问题时，建议仔细审查补充协议的内容，特别是其与原合伙协议的关系以及是否具有独立性。同时，考虑到法律关系的复杂性和不确定性，如有需要，建议咨询专业律师以获取更具体的法律意见。

• 例如，如果补充协议中包含了关于合伙企业清算和债务处理的条款，并且这些条款是独立可执行的，那么即使原合伙协议作废，这些条款仍然可能对合伙人具有约束力。