关于“应付款项超合同时间违约金怎么算”的问题，以下是一个清晰、详细且有深度的解答：
在我国现行法律体系中，对于超出合同约定期限支付款项的违约金计算，主要遵循以下原则：
一、合同有约定的情况
- 依约执行：
- 如果合同中明确规定了违约金的计算公式或具体数额，如“每逾期一日，按未付款项的X%支付违约金”，那么应严格按照合同约定的方式执行。
二、合同无约定的情况
- 法定计算：
- 当合同中没有对违约金作出规定时，债权人有权要求违约方承担因其违约行为给自身带来的经济损失。
- 损失赔偿金的具体数额应与违约行为所导致的实际损失相匹配，包括合同正常履行后可预期获得的收益，但不能超过违约方在签订合同时所能预见或应当预见到的因违约行为可能引发的损失。
- 损失的计算方式可能涉及到资金占用期间的利息损失等方面。
三、司法实践中的处理
- 在司法实践中，法院会结合违约方的过失程度、合同执行状况以及实际损失等多重因素，来合理地确定违约金的具体数额。
- 如果双方对违约金的数额存在争议，当事人可以请求人民法院或仲裁机构进行适当调整。
四、其他相关要点
诉讼时效：
- 根据《中华人民共和国民法典》规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。从合同约定的付款期限届满次日起算，若债权人在此期间内向债务人主张过权利，则会产生诉讼时效中断的效果。
违约责任的承担：
- 超出合同期限未付款属于违约行为，违约方需承担违约责任，包括继续履行、支付逾期利息、赔偿损失等。
- 如果合同中有约定违约金条款，违约方还需按照约定支付违约金。
综上所述，超出合同期限付款违约金的计算需要综合考虑合同约定、法律规定以及司法实践中的处理原则。在具体操作中，应仔细审查合同条款，结合实际情况进行合理计算，并在必要时寻求法律途径进行解决。