公司请假扣费是否合法，需根据具体情况判断。以下是几种不同情况下的详细分析：

1. 事假扣费：

   • 若公司有明确合法的规章制度，且该制度经过民主程序制定并向员工公示，其中对请事假扣工资有具体规定，比如按日或小时扣发相应工资，这通常是合法的。因为事假期间员工未提供劳动，公司根据制度扣发相应工资符合常理。
   • 扣款计算方式一般按照“月工资÷21.75×请假天数”来进行，其中21.75为劳动法规定的月计薪天数。

2. 病假扣费：

   • 若员工请的是病假，公司应支付病假工资。按照相关规定，职工患病或非因工负伤治疗期间，在规定的医疗期内，企业应按有关规定支付其病假工资或疾病救济费，病假工资或疾病救济费可以低于当地最低工资标准支付，但不能低于最低工资标准的80%。
   • 若公司扣发病假工资至低于此标准，则不合法。

3. 无合法制度或随意扣费：

   • 若公司没有合法有效的规章制度，或随意扣发请假员工工资，这种行为是不合法的。
   • 员工可与公司协商，要求公司说明扣除依据并补发不合理扣除的工资。若协商不成，员工可通过劳动仲裁、诉讼等法律途径维护自身合法权益。

此外，对于加班工时的扣除，也需要特别注意：

• 原则上，请假与加班费无直接联系，用人单位不能因为劳动者请假而扣除其应得的加班费。
• 但在某些特殊情况下，如果双方有明确的约定，或者用人单位的规章制度有相关规定，并且这些约定或规定符合法律法规的要求，那么请假扣加班工时可能在一定程度上被认定为合法。

综上所述，公司请假扣费是否合法，取决于公司的规章制度、扣款方式以及请假类型等多个因素。如果您认为公司扣费行为不合法或存在争议，建议首先与公司进行沟通协商；协商不成时，可以向当地劳动管理部门投诉或举报；必要时，还可以依法向人民法院申请支付令或提起诉讼来维护自己的合法权益。