在盗窃案件中，盗窃3000元后退赔了，检察院是否还会起诉，这是一个需要根据具体情况来判断的问题。以下是对此问题的详细分析：
一、结论前置
盗窃后退赔并不能保证检察院一定不会起诉，但退赔行为确实是一个重要的量刑考虑因素，可能会对检察院的起诉决定以及后续的量刑产生积极影响。
二、可能会起诉的情况
达到起诉标准：
- 盗窃公私财物价值达到“数额较大”的标准（如一千元至三千元以上），检察院通常会提起公诉。退赔只是对犯罪后果的弥补，不能完全消除犯罪行为本身的违法性。
- 例如，如果盗窃了他人价值5000元的财物，即使主动退赔，由于盗窃数额达到了“数额较大”的标准，检察院仍可能会依法提起公诉。
存在其他严重情节：
- 如果犯罪嫌疑人在盗窃过程中存在入户盗窃、携带凶器盗窃、扒窃等恶劣情形，或者具有多次盗窃等记录，即使退赔了财物，检察院也可能会起诉。
- 例如，多次在商场扒窃他人财物，虽然每次得手后都归还了财物，但由于多次扒窃的行为性质恶劣，检察院依然可能会提起公诉。
三、可能不起诉的情况
情节显著轻微、危害不大：
- 如果盗窃数额较小，且犯罪嫌疑人及时退赔并取得了被害人的谅解，综合全案来看情节显著轻微、危害不大的，检察院可以作出不起诉决定。
- 例如，在超市一时贪念，盗窃了价值较小的商品，事后马上后悔并主动归还商品且道歉赔偿。由于盗窃数额小且情节轻微，检察院有可能决定不起诉。
符合相对不起诉条件：
- 如果犯罪嫌疑人盗窃后退赔，并且具有自首、立功、初犯、偶犯等情节，检察院综合考虑认为犯罪情节轻微，不需要判处刑罚或者免除刑罚的，可以作出相对不起诉决定。
- 例如，盗窃了他人财物后，主动投案自首，如实供述自己的罪行，同时积极退赔全部财物并获得了被害人的谅解。检察院经审查认为犯罪情节轻微，可能会作出相对不起诉决定。
酌定不起诉：
- 在某些情况下，如果犯罪情节相对轻微，并且嫌疑人在案发后积极退赃、退赔，获得了被害人的谅解，同时有悔罪表现，检察机关可能会根据宽严相济的刑事政策，作出酌定不起诉的决定。
四、建议
对于盗窃案件的嫌疑人来说，案发后积极配合调查、主动退赔并争取被害人的谅解是非常重要的。这些行为不仅有助于减轻自己的刑事责任，还可能影响检察院的起诉决定。同时，也建议直接向我咨询以获取更准确的法律建议和帮助。
综上所述，盗窃3000元后退赔了，检察院是否还会起诉取决于具体的案情和犯罪嫌疑人的表现。退赔行为虽然是一个积极的量刑考虑因素，但并不能完全保证检察院不会起诉。因此，建议嫌疑人在案发后采取积极的态度和行为，并咨询专业律师以获取更准确的法律建议。