针对您提出的“刑事申诉案子中有刑讯逼供、程序违法以及对几个被告的供述没有按法庭程序查证属实”的问题，我将从以下几个方面进行详细分析：

1. 刑讯逼供的处理

刑讯逼供是严重违反刑事诉讼程序的行为，其获得的证据应当被排除。如果您在刑事申诉案子中认为存在刑讯逼供的情况，您需要提供具体的线索或证据，如被告人的伤痕、审讯录像、证人证言等，以证明刑讯逼供的存在。一旦刑讯逼供被证实，相关证据将被视为非法证据，不能作为定案的根据。

2. 程序违法的处理

程序违法同样可能影响案件的公正性。在刑事申诉中，如果您发现案件存在程序违法的情况，如超期羁押、非法搜查、扣押等，您应当指出具体的违法点，并提供相应的证据或线索。法院在审查申诉时，会重点审查程序是否合法，对于确实存在程序违法的案件，可能会启动再审程序进行纠正。

3. 被告供述未查证属实的处理

在刑事诉讼中，被告人的供述必须经过法庭的查证属实才能作为定案的根据。如果您认为案件中几个被告的供述没有按法庭程序查证属实，您应当指出哪些供述存在问题，以及为何认为它们没有查证属实。这可能涉及到供述的收集方式、供述的内容是否与其他证据相互印证、供述是否存在矛盾等方面。法院在审查申诉时，会重新审查这些供述的真实性和合法性，以确保案件的公正性。

4. 综合建议

针对您提出的申诉情况，我建议您首先整理好相关的证据和线索，包括证明刑讯逼供、程序违法以及供述未查证属实的材料。然后，您可以向有管辖权的法院提出申诉，并附上详细的申诉理由和证据材料。在申诉过程中，您可以聘请专业的律师为您提供法律帮助，以确保您的申诉权利得到充分保障。

总之，刑事申诉是一个复杂而严谨的过程，需要您提供充分的证据和理由来支持您的申诉主张。如果您在申诉过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。