公司内部认定工伤没有申报，对工资有影响。具体来说，如果公司未按照规定申报工伤，可能会产生以下后果，这些后果直接或间接地影响到员工的工资及福利待遇：
员工权益保障受阻：
- 员工在受伤后，如果公司未及时申报工伤，那么员工可能无法在第一时间获取工伤待遇，包括治疗费用的报销、康复期间的补贴等。这将直接影响员工的工资收入和生活质量。
停工留薪期工资问题：
- 根据相关规定，员工在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。但如果公司未申报工伤，可能会拖延或拒绝支付这段期间的工资，从而对员工造成经济损失。
企业赔偿责任：
- 即便公司没有申报工伤，一旦经认定属于工伤，公司仍需要承担赔偿责任。这些赔偿项目包括医疗费、停工留薪期工资、伤残津贴等。如果公司未按时支付这些赔偿，员工的工资收入将受到影响。
法律风险与罚款：
- 公司未申报工伤还可能面临法律风险。劳动行政部门有权责令企业改正不申报工伤的行为，并可能处以罚款。这些罚款和法律风险虽然不直接影响员工的工资，但会间接影响公司的财务状况，进而可能影响员工的工资发放和福利待遇。
综上所述，公司内部认定工伤但没有申报，会对员工的工资及福利待遇产生不良影响。因此，建议公司在员工受伤后及时申报工伤，以保障员工的合法权益和公司的正常运营。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。