工程款如何约定是一个涉及多个方面的重要问题，以下是对此问题的详细解答：
一、工程价款的计价方式
在工程建设实务中，发包人与承包人在签订施工合同时，对于工程价款的计价方式，一般有以下三种模式：
固定总价：
- 适用于合同工期较短且工程合同总价较低的工程。
- 合同总价在约定的风险范围内不作调整，风险范围外的调整方法需在合同中明确。
- 采用此模式时，双方应对合同范围和施工内容有充分了解，并对人工、材料、机械设备的市场价格有准确判断。
固定单价：
- 双方在合同中约定综合单价包含的风险范围和风险费用的计算方法。
- 在约定的风险范围内，综合单价不再调整；风险范围以外的综合单价调整方法，应在合同中约定。
- 要求发包人和承包人对市场价格的历史走势和未来趋势有清晰的判断分析。
可调价格：
- 包括可调综合单价和措施费等。
- 双方应在合同中约定综合单价和措施费的调整方法，调整因素可能包括法律、行政法规变化、价格调整、设计变更等。
二、工程预付款的约定
工程预付款的约定同样需要谨慎周全，主要可从以下几个方面着手：
预付款的额度：
- 应依据工程项目的规模、复杂程度、施工周期等因素合理确定，一般可参考合同价款的一定比例，如10%~30%。
支付时间：
- 明确约定在合同签订后的特定阶段支付，如收到承包人提交的预付款保函后的若干工作日内。
支付方式：
- 规定具体的支付形式，如银行转账等，并注明收款账户信息。
扣回方式：
- 可以约定在工程进度达到一定比例后，按照一定比例分阶段扣回预付款；也可根据每月完成的工程量逐步扣回。
违约责任：
- 明确若发包人未按时足额支付预付款，或承包人未按约定使用预付款，应承担的违约责任，如支付违约金、赔偿损失等。
三、其他注意事项
在约定工程款时，还需注意以下几点：
- 合同条款的明确性：所有关于工程款的约定都应明确、具体，避免模糊不清导致后续纠纷。
- 风险分担的合理性：双方应合理分担价格变动等风险，确保合同的公平性和可执行性。
- 法律合规性：所有约定都应符合相关法律法规的要求，确保合同的合法性。
综上所述，工程款的约定是一个复杂而细致的过程，需要双方充分沟通、协商，并明确各项条款和内容，以确保合同的顺利执行和工程项目的顺利进行。