在刑事案件中，如果公安机关发现了新证据，其处理流程会根据相关法律法规和程序进行，以确保案件的公正、公平处理。以下是对新证据处理流程的详细解答：
一、新证据的收集与初步核实
收集新证据：
- 公安机关在发现新证据后，会立即进行收集工作。
- 收集过程中，会确保新证据的相关性、合法性和有效性，并严格遵守法定程序，避免非法取证。
- 新证据的来源、证明内容及其与案件的相关性都会被详细记录。
初步核实：
- 收集到的新证据会经过初步核实，以确认其真实性和与案件的关联性。
二、根据新证据的性质作出相应处理
对犯罪嫌疑人有利的新证据：
- 如果新证据表明犯罪嫌疑人可能不存在社会危险性或罪行较轻，公安机关可能会考虑变更强制措施，如取保候审或监视居住。
- 如果新证据足以证明犯罪嫌疑人无罪，公安机关将依法撤销案件，释放被采取强制措施的犯罪嫌疑人，并及时通知原批准逮捕的人民检察院。
对犯罪嫌疑人不利的新证据：
- 如果新证据进一步证明了犯罪事实或增加了新的犯罪事实、情节，公安机关会将其补充到侦查卷宗中，并继续完善证据链条。
- 在某些情况下，如果发现犯罪嫌疑人另有重要罪行，公安机关可能会重新计算侦查羁押期限，并制作相关通知书送达看守所及备案检察院。
三、新证据的提交与审查
提交新证据：
- 公安机关会将新收集的证据及时提交给原案件处理部门，并附上详细的说明和报告。
- 如果案件已经移送审查起诉，公安机关会及时将新证据移送人民检察院，以影响案件的定性、量刑等关键环节。
审查与判断：
- 在审查起诉阶段，人民检察院会对公安机关提交的新证据进行审查判断。
- 如果新证据对定罪量刑产生影响，人民检察院可能会要求公安机关补充侦查，或者自行进行补充侦查。
- 在某些情况下，新证据甚至可能影响人民检察院是否提起公诉的决定。
四、特殊情况下的处理
- 如果公安机关之前已作出不予立案或撤销案件的决定，但在后续工作中发现了新证据，当事人或公安机关自身可以依法提交复议申请书及新证据，要求重新审查案件。
- 公安机关会对新提交的证据进行全面审查，并根据审查结果作出重新立案、继续侦查或维持原决定等处理。
五、遵循法律程序与保护当事人权益
- 在整个处理过程中，公安机关会严格遵守《中华人民共和国刑事诉讼法》及相关法律法规的规定。
- 公安机关会充分保障当事人的合法权益，避免不必要的侵害。
- 对于特殊情况，如并案处理或补充侦查，公安机关会依法进行，并确保案件的准确处理。
综上所述，公安机关在发现新证据时，会依法进行收集、提交、审查和处理。整个流程都会严格遵守法律程序，充分保障当事人的合法权益，以确保案件的公正、公平处理。