在盗窃案中，如果检察院只认定了三千多块钱的盗窃金额，但实际赔偿了三万多块钱，那么对于多赔的钱是否可以追回，这主要取决于赔偿的具体情况和法律程序。

1. 赔偿性质与追回可能性：

   • 如果多赔的钱是基于双方自愿达成的赔偿协议，且该协议不违反法律规定，那么一般情况下，这部分钱款是难以追回的。因为赔偿协议一旦达成并履行，就视为双方对赔偿金额和方式达成了共识。
   • 如果多赔的钱是由于误解、欺诈、胁迫等非自愿因素导致的，那么受害方有权向法院提起诉讼，要求撤销或变更赔偿协议，并追回多赔的钱款。

2. 法律程序与追回途径：

   • 如果受害方认为赔偿存在不当之处，首先应与赔偿方进行协商，尝试通过和解的方式解决争议。
   • 如果协商无果，受害方可以向法院提起民事诉讼，请求法院对赔偿协议进行审查，并根据实际情况作出判决。
   • 在诉讼过程中，受害方需要提供充分的证据证明赔偿存在不当之处，以及多赔的钱款应当被追回的理由。

3. 实际操作中的考虑：

   • 在决定是否追回多赔的钱款时，受害方应综合考虑诉讼成本、时间成本以及追回钱款的可能性等因素。
   • 如果多赔的钱款数额不大，或者追回过程中可能面临较大的风险和困难，那么受害方可能会选择放弃追回。

综上所述，对于盗窃案中多赔的钱是否可以追回，这需要根据具体情况来判断。如果赔偿是基于自愿达成的协议，且不存在不当之处，那么一般情况下是难以追回的。但如果赔偿存在不当之处，受害方可以通过法律程序来维护自己的权益，并尝试追回多赔的钱款。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。