股东直接任命董事在一般情况下是无效的。下面我将从法律角度详细解释这一结论，并给出相应的法律依据。

一、法律解释

1. 董事选举的法定程序：

   • 根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，董事一般由股东会选举产生。这是公司法关于董事产生程序的强制性规定。
   • 在特定情况下，如两个以上的国有企业或其他两个以上的国有投资主体投资设立的有限责任公司，董事会成员中的职工代表由公司职工代表大会选举产生。

2. 股东提名与直接任命的区别：

   • 股东提名董事是指股东有权向股东会提出董事候选人，但最终是否当选需由股东会按照法定程序进行选举。
   • 股东直接任命董事则意味着跳过了股东会的选举程序，这直接违反了公司法关于董事产生程序的强制性规定。

3. 无效条款的认定：

   • 如果公司章程或股东之间的合同中出现了“由股东直接任命董事”的条款，该条款将因违反公司法的强制性规定而被认定为无效。

二、法律依据

• 《中华人民共和国公司法》第三十七条规定：“股东会行使下列职权：……（二）选举和更换非由职工代表担任的董事、监事，决定有关董事、监事的报酬事项；……”
• 《中华人民共和国公司法》第四十四条规定：“董事会成员中应当有公司职工代表。董事会中的职工代表由公司职工通过职工代表大会、职工大会或者其他形式民主选举产生。”
• 《中华人民共和国公司法》第一百零八条规定：“股份有限公司设董事会，其成员为五人至十九人。董事会成员中可以有公司职工代表。董事会中的职工代表由公司职工通过职工代表大会、职工大会或者其他形式民主选举产生。”

三、实际操作建议

1. 遵守法定程序：公司在选举董事时，应严格遵守公司法的相关规定，通过股东会按照法定程序进行选举。
2. 完善公司章程：公司章程应明确董事的选举程序、股东提名权及其行使方式等，以确保公司治理结构的合法性和有效性。
3. 维护股东权益：股东应积极参与公司治理，通过合法途径行使自己的权利，维护公司和自身的合法权益。

综上所述，股东直接任命董事是无效的，因为违反了公司法关于董事产生程序的强制性规定。公司应遵守法定程序选举董事，并确保公司治理结构的合法性和有效性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。