工伤在编和不在编的主要区别在于两者所依据的法律法规、赔偿主体及赔偿标准可能存在不同。下面我将对此进行详细分析：
一. 法律依据不同
在编人员：通常指的是具有正式编制的员工，如公务员、事业单位工作人员等。他们的工作关系及工伤处理主要依据《公务员法》、《事业单位人事管理条例》等相关法律法规。例如，公务员因公致残的，按照《公务员法》的相关规定享受工伤待遇。
不在编人员：一般指的是与企业签订劳动合同的员工，包括临时工、合同工等。他们的工作关系及工伤处理主要依据《劳动法》、《劳动合同法》及《工伤保险条例》等法律法规。这类员工发生工伤时，需按照《工伤保险条例》的规定进行工伤认定和赔偿。
二. 赔偿主体不同
在编人员：其工伤赔偿通常由所在单位或国家财政承担。例如，公务员的工伤赔偿由所在单位按照国家规定支付。
不在编人员：其工伤赔偿主要由工伤保险基金承担，用人单位也需承担部分责任。员工发生工伤后，需先通过工伤认定，然后由工伤保险基金支付相应的工伤待遇。
三. 赔偿标准可能不同
在编人员：由于他们的工伤赔偿主要由国家财政或所在单位承担，因此赔偿标准可能相对较高，且通常与公务员的薪资、福利等挂钩。
不在编人员：他们的工伤赔偿标准主要依据《工伤保险条例》的规定，赔偿项目包括医疗费、伤残补助金、一次性工伤医疗补助金等，具体数额与员工的薪资、伤残等级等因素有关。
综上所述，工伤在编和不在编的区别主要体现在法律依据、赔偿主体及赔偿标准上。我建议在具体处理工伤问题时，需根据员工的编制情况选择适用的法律法规，并据此进行工伤认定和赔偿处理。如有进一步需要，您可以继续咨询我。