合同中约定不上班就扣社保是不合法的。下面我将从几个方面详细解释这一结论：

1. 社保缴纳的法律规定：

   • 社会保险是法定福利，其缴纳是基于劳动关系的存在，与劳动者是否上班、出勤情况无直接关系。
   • 用人单位有义务为劳动者缴纳社会保险，这是法律规定的强制性义务，不能通过合同约定来规避。

2. 合同约定的合法性：

   • 劳动合同中的条款应当符合法律法规的规定，不能违反法律强制性规定。
   • 约定不上班就扣社保的条款，实质上是在规避用人单位的法定责任，因此是无效的。

3. 劳动者的权益保护：

   • 劳动者享有休息、休假的权利，这是劳动法赋予的基本权益。
   • 用人单位不能因劳动者休息、休假或未出勤就扣减其社会保险，这侵犯了劳动者的合法权益。

4. 实际操作中的建议：

   • 如果遇到用人单位以不上班为由扣减社保的情况，劳动者可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
   • 在签订劳动合同时，劳动者应仔细审查合同条款，确保自身权益不受侵害。

综上所述，合同中约定不上班就扣社保是不合法的。如果你在这方面遇到了问题，可以直接向我咨询，我会为你提供更详细的法律建议和帮助。