“首违不罚”不能作为不予立案的理由。具体分析如下：

一. “首违不罚”的含义与应用

• “首违不罚”是指对于初次违法且危害后果轻微，并在规定时间内及时改正的行政违法行为，可以不予行政处罚。这是一种柔性执法方式，旨在鼓励和引导当事人自觉守法、自我纠错。
• 然而，“首违不罚”并不等同于不予立案。立案是行政执法程序的一个环节，是对违法行为进行初步审查并决定是否启动正式调查程序的过程。

二. 立案与“首违不罚”的关系

• 立案是对违法行为的初步认定，是启动行政执法程序的前提。即使最终决定“首违不罚”，也需要先经过立案程序对违法行为进行审查。
• “首违不罚”是在立案并调查清楚违法行为后，根据违法行为的性质、情节和危害后果等因素，作出的不予行政处罚的决定。

三. 法律依据

• 根据《行政处罚法》第三十三条第一款的规定，“初次违法且危害后果轻微并及时改正的，可以不予行政处罚”。但这并不意味着可以不予立案。
• 生态环境执法等领域的实践也表明，“首违不罚”制度的适用是在立案并调查清楚违法行为之后，根据具体情况决定是否不予行政处罚。

四. 实际操作中的注意事项

• 行政机关在适用“首违不罚”制度时，应严格遵循法定程序，先立案调查清楚违法行为，再根据具体情况决定是否不予行政处罚。
• 不应以“首违不罚”为由拒绝立案或销案处理，这样会损害行政执法的公正性和权威性。

综上所述，“首违不罚”不能作为不予立案的理由。行政机关在执法过程中应严格遵循法定程序，确保行政执法的公正性和权威性。同时，也应积极推广“首违不罚”等柔性执法方式，鼓励和引导当事人自觉守法、自我纠错。如有进一步需要，您可以继续咨询我。