公司员工得了疾病出院，应按照以下步骤办理相关手续，并了解可能涉及的权益：
一. 办理出院手续
获取出院医嘱和证明：
- 职工在住院期间，经过医生的治疗和观察，病情得到稳定或改善后，医生会开具出院医嘱和出院证明。这是办理出院手续的第一步，也是后续步骤的基础。
办理费用结算：
- 职工需携带押金单、身份证和医保卡等相关证件，到住院处的结算窗口进行费用结算。
- 结算过程中，医院会打印出正式的发票和住院详细清单，作为职工支付费用和后续报销的凭证。
- 如果职工参加了医疗保险，根据《中华人民共和国社会保险法》的相关规定，符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，可以从基本医疗保险基金中支付。因此，在结算时，医院会直接与社会保险经办机构进行结算，职工只需支付个人应承担的部分费用。
取出院药物和核对资料：
- 根据医生的出院医嘱，职工可能需要带一些药物回家继续使用。此时，职工需凭取药单到中心药房取出相应的药物。
- 在取完药物后，职工应返回护士站，取回自己的门诊病历和出院证明，并仔细核对这些资料是否准确无误。
正式办理出院：
- 完成以上所有步骤后，职工即可正式办理出院。此时，医院会收回职工的住院手环等标识，并祝愿职工早日康复。
二. 了解可能涉及的权益
医疗期内的权益保护：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十二条第三项规定，劳动者患病或者非因工负伤，在规定的医疗期内的，用人单位不得依照本法第四十条、第四十一条的规定解除劳动合同。这意味着，在医疗期内，除非劳动者有重大过错，否则用人单位不能随意辞退。
- 医疗期的具体规定：医疗期的长短通常根据劳动者的实际工作年限和在本单位工作年限来确定，具体可参考原劳动部《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》。
医疗期满后的处理：
- 医疗期满后，用人单位应对劳动者的身体状况进行评估，看其是否能继续从事原工作。
- 如果劳动者不能从事原工作，根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十条第一项规定，用人单位应当为劳动者提供培训或者调整工作岗位的机会。
- 如果经过培训或者调整工作岗位后，劳动者仍然不能适应工作，用人单位在提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资后，可以依法解除劳动合同。
解除劳动合同的补偿：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十六条和第四十七条的规定，如果用人单位因劳动者患病在医疗期满后不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作而解除劳动合同，用人单位应当向劳动者支付经济补偿。经济补偿的计算标准为劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
- 此外，如果用人单位非法解除劳动合同，根据《中华人民共和国劳动合同法》第八十七条的规定，用人单位应当按照经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。
我建议：公司员工在出院后，除了按照上述步骤办理出院手续外，还应了解自己的权益，特别是在医疗期内和医疗期满后的权益保护。如果用人单位的处理方式不符合法律规定，员工可以通过与用人单位协商、申请劳动仲裁或提起诉讼等方式来维护自己的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。