对于高校本科毕业生通过劳动合同就业后，劳动合同是否会存入个人档案的问题，我们可以从以下几个方面进行详细解答：
一、个人档案的内容与作用
个人档案是反映个人政治面貌、学习经历、工作经历等历史记录的重要材料。对于高校毕业生而言，档案中通常包含学籍材料、入党入团材料、奖惩记录等。在毕业后，这份档案将成为相关部门进行人事管理和服务的重要依据，如办理职称评审、报考公务员、参加事业单位公开招聘、入党政审、养老待遇核准等事项时，都需要用到档案中的相关材料。
二、劳动合同的存放与档案的关系
劳动合同本身：劳动合同是劳动者与用人单位之间确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。根据常规做法，劳动合同原件通常由用人单位和劳动者各自保管，而不是直接存入个人档案。
劳动合同相关材料：虽然劳动合同原件不直接存入档案，但劳动者在就业过程中形成的与劳动合同相关的材料，如企业录用手续、就业登记、劳动用工备案等，这些材料在必要时是需要归档的。这些归档材料可以作为劳动者工作经历的证明，也是档案管理服务机构提供服务的重要依据。
三、档案的转递与保管
档案转递：毕业后，根据毕业生的就业去向，档案会转递到相应的单位或机构。如果到机关、国有企事业单位就业，档案会转递到就业单位；如果到非公单位就业、灵活就业或自主创业，档案会转递到就业创业地或户籍地公共就业人才服务机构。
档案保管：非公单位就业和暂未就业的高校毕业生档案，可以保管在档案管理服务机构，如县级以上人社部门所属的公共就业人才服务机构。这些机构负责档案的保管、整理和提供利用服务。
四、建议与注意事项
及时归档：高校毕业生在就业过程中，应及时将反映工作经历、教育培训、职业资格、职称等材料，以及工作变动中形成的与劳动合同相关的材料，主动移交给档案管理服务机构进行归档。
查询档案：毕业生可以通过原就读高校相关部门或全国人力资源和社会保障政务服务平台查询档案转递信息，确保自己的档案得到妥善保管和利用。
综上所述，高校本科毕业生通过劳动合同就业后，劳动合同原件通常不直接存入个人档案，但与劳动合同相关的材料在必要时是需要归档的。毕业生应重视自己的档案管理和利用，确保档案的完整性和准确性。