如果公司以员工身份申请贷款，员工可以报警处理，并且应当采取一系列措施来保护自己。以下是对这一问题的详细分析和建议：

1. 报警的合理性：

   • 公司以员工身份贷款，很可能涉及伪造员工信息、盗用员工身份等违法行为。这种情况下，员工完全有权报警，让警方介入调查并追究相关责任人的法律责任。

2. 报警前的准备：

   • 在报警之前，员工应尽可能收集相关证据，如贷款合同、身份证明文件、公司相关文件等，以便警方能够更快地了解案情并展开调查。

3. 报警后的处理：

   • 报警后，员工应积极配合警方的调查工作，提供所需的信息和证据。同时，也可以考虑咨询专业律师，了解自己在法律上的权益和可能的救济途径。

4. 其他保护措施：

   • 除了报警外，员工还可以采取其他措施来保护自己。例如，与公司进行沟通，要求公司立即停止违法行为并赔偿损失；向相关部门（如银保监会、工商局等）举报公司的违法行为；或者通过法律途径追究公司的民事责任。

5. 防范未来风险：

   • 为了避免类似情况再次发生，员工应加强个人信息保护意识，不要随意将个人信息泄露给公司或他人。同时，也可以定期查询自己的信用报告，及时发现并处理任何异常贷款或信用记录。

综上所述，如果公司以员工身份贷款，员工不仅可以报警处理，还应当采取一系列措施来保护自己并追究相关责任人的法律责任。如果你在这个过程中有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。