入职两年后自行离职未办离职手续，不影响一个月后在新公司办理入职。以下是对此问题的详细分析：

一. 劳动关系终止的法律规定

1. 劳动合同的解除：根据《劳动合同法》第三十七条，劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。劳动者在试用期内提前三日通知用人单位，可以解除劳动合同。这表明，劳动者有权单方面解除劳动合同，且只需提前通知用人单位。
2. 离职手续的办理：虽然《劳动合同法》第五十条规定了用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，并办理相关手续，但并未规定未办理离职手续会影响劳动者在新单位的入职。

二. 离职手续与入职新公司的关系

1. 离职手续的必要性：离职手续主要是用于处理劳动者与用人单位之间的工资、社保、公积金等结算问题，以及工作交接等事宜。未办理离职手续可能会影响这些事项的结算，但并不会影响劳动者与新用人单位建立劳动关系。
2. 新公司入职的要求：新公司在办理入职时，主要关注的是劳动者是否具备入职资格，如是否与其他公司存在未解除的劳动关系、是否具备所需的职业技能和资质等。只要劳动者满足这些条件，新公司就可以为其办理入职手续。

三. 实际操作中的建议

1. 尽快办理离职手续：尽管未办理离职手续不影响在新公司的入职，但为了避免与原用人单位产生不必要的纠纷，建议劳动者在离职后尽快办理离职手续。
2. 与新公司沟通：在新公司入职前，可以与人力资源部门沟通，说明之前未办理离职手续的情况，并询问是否需要提供其他相关证明或文件。

我建议：您可以放心地在新公司办理入职手续，但同时也应尽快与原用人单位联系，办理离职手续，以确保所有事项都得到妥善处理。如有进一步需要，您可以继续咨询我。