《关于办理刑事案件严格排除非法证据若干问题的规定》第25条主要规定了法庭对证据收集合法性有疑问时的处理方式。以下是对该法条的详细解读：
一. 法条原文及解读
法条原文：“被告人及其辩护人在开庭审理前未申请排除非法证据，但在庭审过程中提出申请的，应当说明理由。人民法院经审查，对证据收集的合法性有疑问的，应当进行调查；对证据收集的合法性没有疑问，且没有新的线索或者材料表明可能存在非法取证的，可以决定不再进行调查并说明理由”。
解读：此条规定明确了被告人在庭审过程中提出排除非法证据申请的处理方式。即使被告人在开庭前未提出申请，只要在庭审中有合理的理由，法院仍应对其申请进行审查。若法院对证据收集的合法性产生疑问，必须进行调查；若无疑问且没有新线索表明非法取证，法院可以决定不再调查，但需说明理由。
二. 法条适用情形
庭审中提出排除非法证据申请：被告人在庭审过程中，基于某种原因（如新发现的线索、对之前证据的重新评估等）提出排除非法证据的申请。
法院对证据合法性有疑问：法院在审查被告人的申请后，认为证据收集的合法性存在疑问，需要进一步调查以确认证据的合法性。
三. 法条意义
保障被告人权利：允许被告人在庭审中提出排除非法证据的申请，为被告人提供了更多的救济机会，有助于保障其合法权益。
确保司法公正：法院对证据收集的合法性进行审查，有助于排除非法证据，确保案件的公正审理。
提高诉讼效率：对于无明显疑问且无新线索的案件，法院可以决定不再进行调查，有助于提高诉讼效率。
我的观点：第25条的规定体现了刑事诉讼中对非法证据排除的严谨态度，既保障了被告人的合法权益，又确保了司法公正和诉讼效率。在司法实践中，应严格遵循这一规定，确保每一起案件都能经得起法律和历史的检验。如有进一步需要，您可以继续咨询我。