结论前置：申请法院强拆后，如果被告自行拆除了建筑物，原告预交的强拆费用一般不予返还。

分析说明：

在征地拆迁的语境下，当申请法院进行强制拆除时，通常需要原告预交一定的费用，这些费用主要用于支付强制拆除过程中可能产生的各项成本，如人工费、机械费等。然而，如果被告在法院执行强制拆除之前自行拆除了建筑物，那么原本预计用于强制拆除的费用实际上并未产生。

从法律的角度来看，预交强拆费用的性质类似于一种预付款或押金，其目的是为了确保强制拆除的顺利进行。既然被告已经自行拆除了建筑物，强制拆除的程序就没有实际执行，因此，原告预交的强拆费用也就没有实际使用。在这种情况下，法院或相关机构通常会根据实际情况，决定不予返还原告预交的强拆费用。

此外，还需要注意的是，具体的法律规定和实践操作可能因地区而异。在某些地区，可能会有更为详细的规定或惯例来处理这种情况。因此，在实际操作中，建议原告咨询当地的法律专业人士或相关机构，以了解具体的法律规定和实践操作。

总结：

综上所述，申请法院强拆后，如果被告自行拆除了建筑物，原告预交的强拆费用一般不予返还。这是因为预交的费用是为了支付强制拆除过程中可能产生的成本，而被告的自行拆除导致这些成本并未实际产生。然而，具体的法律规定和实践操作可能因地区而异，建议原告咨询当地的法律专业人士以获取更准确的信息。