签订工程款欠款协议后，该纠纷的性质确实可能转化为欠款纠纷。以下是详细的分析：

1. 工程款欠款协议的性质：

   • 工程款欠款协议，顾名思义，是双方就工程款支付事宜达成的协议。在建设工程合同中，如果发包人未按照约定支付工程款，承包人可以与发包人签订工程款欠款协议，明确欠款的金额、支付时间、支付方式等。

2. 欠款纠纷的界定：

   • 欠款纠纷，简单来说，就是一方未按照约定支付款项，另一方因此提起诉讼要求支付款项的纠纷。在工程款欠款协议中，如果发包人未按照协议约定支付欠款，承包人就可以基于该协议提起欠款纠纷的诉讼。

3. 转化逻辑：

   • 在签订工程款欠款协议之前，双方之间的纠纷可能主要围绕建设工程合同的履行，包括工程质量、工期、价款等。但一旦签订了工程款欠款协议，双方就工程款支付事宜达成了新的约定，此时的纠纷就主要围绕欠款的支付，因此性质上转化为欠款纠纷。

4. 法律后果：

   • 转化为欠款纠纷后，承包人可以依据工程款欠款协议直接向法院提起诉讼，要求发包人支付欠款。法院在审理此类案件时，会主要依据欠款协议的内容来判断发包人是否应支付欠款及支付的具体金额。

综上所述，签订工程款欠款协议后，如果发包人未按照协议支付欠款，该纠纷的性质确实会转化为欠款纠纷。此时，承包人可以依据欠款协议向法院提起诉讼来维护自己的合法权益。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。