针对您提出的“工程欠款转借款协议直接写借款借条未注明工程欠款转借款，发生纠纷怎么诉讼”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、问题核心与法律风险
首先，我们需要明确问题的核心：您将原本的工程欠款关系，通过一份未明确注明的借款借条来体现，这在法律上可能引发一系列风险。因为工程欠款与个人借款在法律关系上存在显著差异，前者涉及建设工程领域的特殊规定，如工程合同、验收报告、结算单等证据的提交与认定；而后者则主要依据借款合同或借条来认定双方的权利义务。若未明确注明工程欠款转借款的事实，可能导致在诉讼中面临举证不能的风险。
二、诉讼策略与步骤
确认诉讼主体：
- 在起诉前，您需要准确确定被告。根据工程参与情况和合同关系，被告可能是发包方、转包方或违法分包方等。确保不遗漏可能承担责任的主体。
收集证据：
- 尽管借条未明确注明工程欠款转借款，但您仍需收集能证明工程欠款事实及具体金额的证据。这些证据包括但不限于：
- 建设工程合同：规定了双方的权利和义务，是证明工程欠款关系的基础。
- 施工图纸：反映工程的具体要求，有助于证明工程的存在和范围。
- 工程验收报告：证明工程已完成且合格，是确认工程欠款金额的重要依据。
- 结算凭证：明确了工程款项的数额，是证明欠款金额的直接证据。
- 付款记录：显示对方已支付和未支付的情况，有助于证明欠款的未付部分。
- 额外证据：若可能，收集与工程欠款转借款相关的沟通记录、协议草案等，以证明双方曾就工程欠款转借款达成过一致。
撰写起诉状：
- 起诉状中应详细写明原被告的信息，包括姓名、地址、联系方式等。
- 诉讼请求部分，应明确提出支付欠款及利息（如适用）的要求。
- 事实与理由部分，需清晰阐述工程欠款的来龙去脉，包括工程的基本情况、欠款的产生原因、借条的签订背景及未注明工程欠款转借款的事实。同时，应强调您已尽到合理注意义务，且借条的签订并未改变工程欠款的本质。
向有管辖权的法院立案：
- 一般选择工程所在地或被告住所地的法院进行立案。
- 立案时，需提交起诉状、证据材料以及双方的身份信息等。
等待开庭审理：
- 立案后，等待法院安排开庭。
- 庭审中，要充分陈述事实，出示相关证据，并进行合理辩论。特别要强调借条虽未注明工程欠款转借款，但双方的实际法律关系仍为工程欠款关系。
申请强制执行：
- 若胜诉但对方不履行判决，可在规定时间内申请强制执行。
三、特殊情况处理
- 若开庭后变更请求困难：
- 若在庭审过程中发现以借款关系起诉存在举证不能的风险，且变更诉讼请求存在困难，您可以考虑撤诉后重新以工程欠款案由起诉。
- 重新起诉时，需准备充分证据，按工程欠款的法律要求主张权利。
四、建议与总结
建议：
- 在未来的法律文件中，应明确注明工程欠款转借款的事实，以避免类似纠纷的发生。
- 在签订任何法律文件前，建议咨询专业律师，以确保文件的合法性和有效性。
总结：
- 尽管借条未明确注明工程欠款转借款，但您仍可通过收集充分证据、撰写详细起诉状、向有管辖权的法院立案等步骤来维护自己的合法权益。
- 在诉讼过程中，要充分陈述事实、出示证据，并进行合理辩论。若面临举证不能的风险，可考虑撤诉后重新以工程欠款案由起诉。