总公司签合同后，款项是可以打给分公司的，但这一操作需要满足一定的条件和注意事项。

首先，从法律角度来看，总公司与分公司属于同一法人实体，分公司是总公司的分支机构，并不具备独立的法人资格。因此，在总公司签订合同后，分公司可以执行相关决议，包括收款。然而，这一行为需要在总公司的明确授权下进行，并且合同对方也需要同意由分公司收款。

在实际操作中，为确保合法合规并避免潜在风险，建议注意以下几个方面：

1. 明确的授权与合同约定：

   • 总公司应通过内部文件或合同补充协议等形式，明确授权分公司收款，并详细规定收款的具体事宜，如收款账户信息、收款权限等。
   • 建议在合同中直接明确约定由分公司收款，或者签订补充协议进行确认，以确保合同双方的权益得到保障。

2. 税务处理的合规性：

   • 分公司收款时，需要确保发票开具与业务实质相符，通常由提供服务或货物的总公司开具发票。
   • 应避免资金流、发票流和业务流不一致导致的税务风险，建议咨询专业税务人员，确保税务处理符合相关规定。

3. 分公司的合法性与经营范围：

   • 分公司必须具备合法的营业执照和相应的经营范围，否则不能随意进行收款活动。
   • 总公司应对分公司的收款行为进行监督和管理，确保其符合法律法规和公司规定。

4. 与合同对方的沟通与协商：

   • 在实际操作前，务必与合同对方进行充分沟通，确保其同意由分公司收款，并明确收款的具体方式和流程。
   • 若合同对方有疑虑或不同意，应寻求其他解决方案，以确保合同的顺利履行。

综上所述，总公司签合同后款项可以打给分公司，但需要满足明确的授权与合同约定、税务处理的合规性、分公司的合法性与经营范围以及与合同对方的沟通与协商等条件。如有任何疑问或需要更详细的法律咨询，建议寻求专业律师的帮助以确保合法合规。