总包单位确实可以不通过分包单位直接给农民工发放工资。以下是对这一问题的详细解答：

一、法律法规依据

根据《保障农民工工资支付条例》等相关法律法规，总包单位在工程建设中不仅有权支付农民工工资，而且承担着确保农民工工资及时、足额支付的重要责任。这一制度设计旨在保护农民工的合法权益，防止因分包单位问题导致的欠薪事件。具体来说，法律规定了总包单位代发工资的权利与义务，即总包单位需根据分包单位编制的工资支付表，通过农民工工资专用账户直接将工资支付到农民工本人的银行账户。

此外，如陕西省等地方也出台了具体的建筑施工企业农民工工资支付办法，明确规定所有建设项目一律由施工总承包企业代分包企业直接支付农民工工资，严禁通过自然人身份的“包工头”给农民工支付工资。

二、现实操作意义

1. 资金管控优势：总包单位在工程资金的掌握和调配方面通常具有更强的能力和资源。由总包单位来支付农民工工资，可以更好地对资金进行统筹安排和监管，确保农民工工资的及时支付。

2. 监管与协调便利：作为工程项目的核心管理者，总包单位对工程的进度、质量、人员等方面都有全面的了解和掌控。由总包单位负责支付农民工工资，便于其对分包单位的用工情况和工资发放情况进行监督和管理，一旦发现问题可以及时协调解决。

3. 法律责任明确：如果分包单位拖欠农民工工资，施工总承包单位需先行清偿，再依法进行追偿。这一规定强化了总包单位在保障农民工工资支付中的关键地位，同时也明确了其法律责任。

三、注意事项

1. 确保工资支付表的准确性：总包单位在代发工资时，应严格根据分包单位编制的工资支付表进行支付，并确保支付表的真实性和准确性。

2. 开设农民工工资专用账户：总包单位应开设农民工工资专用账户，专项用于支付该工程建设项目农民工工资，以确保资金的专款专用。

3. 保存相关凭证：总包单位在支付农民工工资后，应向分包单位提供代发工资凭证，并妥善保存相关凭证和记录，以备后续查证。

综上所述，总包单位可以直接给农民工发放工资，这是法律法规赋予的权利和责任。通过直接支付工资，可以更好地保障农民工的合法权益，促进社会的和谐稳定。