在民事诉讼中，如果笔录生效后出现了新证据，当事人确实有权依据新证据进行申诉。以下是对此问题的详细分析：
一、核心结论：
民事诉讼中，笔录生效后发现新证据，当事人可以向法院提出申诉，要求重新审理案件。
二、法律依据：
根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，特别是关于再审程序的规定，当事人在有新的证据，足以推翻原判决、裁定的情况下，可以向法院申请再审。这为新证据出现后的申诉提供了明确的法律依据。
三、申诉条件与程序：
新证据的标准：新证据必须是在原审庭审结束后新发现的证据，或者是原审庭审结束前已经存在，但当事人因客观原因无法取得或者在规定的期限内不能提供的证据。且该证据必须足以推翻原判决、裁定。
申诉的提出：当事人应当向法院提交书面申诉材料，包括申诉书、新证据材料以及证明新证据符合再审条件的相关证据。
法院的审查：法院在收到申诉材料后，会进行审查。如果认为新证据确实足以推翻原判决、裁定，且符合再审条件，法院会裁定再审；否则，会裁定驳回申诉。
再审程序：如果法院裁定再审，案件将重新进入审理程序。在再审程序中，法院会依据新证据重新审查案件事实，并作出新的判决或裁定。
四、注意事项：
申诉时效：当事人提出申诉的时效是有限的，通常是在判决、裁定发生法律效力后的一定期限内。因此，当事人应当及时行使申诉权利。
证据保全：在发现新证据后，当事人应当采取必要的措施保全证据，以防止证据灭失或难以取得。
综上所述，民事诉讼中笔录生效后发现有新证据，当事人完全有权进行申诉。但需要注意的是，申诉必须符合法律规定的条件和程序，且当事人应当及时行使申诉权利并保全相关证据。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。