在交通事故中，如果被判定为次要责任，保险公司通常是会进行赔偿的。下面我将详细解释这一流程：

一、交强险的赔偿

首先，无论事故责任大小，交强险都会在一定限额内进行赔偿。具体限额如下：

• 死亡伤残赔偿限额：18万元
• 医疗费用赔偿限额：1.8万元
• 财产损失赔偿限额：0.2万元

交强险会按照这些限额对受害者进行赔偿，不考虑事故中的责任比例。

二、商业险的赔偿

如果交强险的赔偿限额不足以覆盖全部损失，那么商业险会根据事故责任比例进行赔偿。在大多数情况下，次要责任意味着需要承担大约30%的赔偿责任。这一比例可能会根据具体的保险合同条款有所调整，但通常会保持在30%左右。

三、赔偿的具体流程

1. 报案：事故发生后，首先需要向保险公司报案，并提供相关的事故证明和损失证明。
2. 定损：保险公司会对事故造成的损失进行定损，确定赔偿金额。
3. 理赔：根据定损结果，保险公司会进行理赔，赔偿金额会按照交强险和商业险的规定进行分配。

四、特殊情况说明

• 如果事故中存在多方责任，各方可以根据责任比例进行协商赔偿，或者通过法律途径解决赔偿争议。
• 保险公司的赔偿必须满足保险条款中的各项条件，如果事故不属于保险范围，或者存在保险免赔的情形（如违反保险合同中的某些约定），保险公司可能会拒绝赔偿或相应扣减赔偿金额。

综上所述，如果您在交通事故中被判定为次要责任，保险公司会根据交强险和商业险的规定进行赔偿。但具体的赔偿金额和比例会根据事故损失、保险条款以及责任比例来确定。如果您对赔偿有任何疑问或争议，建议及时咨询保险公司或专业律师，以维护您的合法权益。