跨部门调动相差太大，员工是有权拒绝的。下面我来详细解释一下这个问题：

首先，从劳动法的角度来看，员工有权在劳动合同约定的范围内从事工作，并享有相应的劳动权益。如果跨部门调动涉及到员工工作岗位、工作内容、工作地点或劳动报酬等重大事项的变更，且这些变更超出了劳动合同约定的范围，那么员工是有权拒绝的。

其次，即使劳动合同中有关于岗位调动的条款，但该条款也应当遵循合法、合理、公平的原则。如果调动相差太大，例如从管理岗位调至一线生产岗位，或者从城市调至偏远地区，且没有合理的解释和补偿，那么这种调动可能构成对员工的不公平待遇，员工同样有权拒绝。

当然，员工在拒绝调动时，应当注意以下几点：

1. 明确拒绝的理由：员工应当基于合理的理由拒绝调动，如调动不符合劳动合同约定、调动后的工作条件或待遇明显降低等。
2. 与用人单位沟通：在拒绝调动前，建议员工与用人单位进行充分沟通，表达自己的意见和诉求，并尝试寻求双方都能接受的解决方案。
3. 保留证据：如果员工认为调动存在不公平或违法的情况，应当保留相关证据，如劳动合同、调动通知、工资单等，以便在必要时维护自己的合法权益。

总之，跨部门调动相差太大时，员工是有权拒绝的。但员工在拒绝调动时，应当明确理由、与用人单位沟通，并保留相关证据以维护自己的合法权益。如果你在这方面遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。