关于“政府采购限额以上代理费由谁承担”的问题，这主要涉及到政府采购活动的相关规定以及代理费用的承担原则。以下是对此问题的详细解答：
结论：政府采购限额以上代理费的承担主体，通常依据政府采购合同或相关法律法规的约定来确定，可能由采购人、采购代理机构或中标（成交）供应商承担，也可能由多方共同分担。
分析说明：
依据合同约定：
- 在政府采购活动中，采购人与采购代理机构之间会签订委托代理协议，该协议中通常会明确代理费用的承担方式。如果合同中有明确约定，那么代理费用的承担就应按照合同约定执行。
依据法律法规：
- 在没有合同约定或合同约定不明确的情况下，可以参照相关的法律法规来确定代理费用的承担主体。例如，某些地方政府采购管理办法可能规定了代理费用的承担原则或标准。
实践中的做法：
- 在实践中，政府采购限额以上代理费的承担方式可能因地区、行业或项目特点而有所不同。有的地区可能规定由采购人承担，有的地区则可能规定由中标（成交）供应商承担，或者由采购人和中标（成交）供应商共同分担。
特殊情况：
- 对于某些特殊项目或特殊情况，代理费用的承担方式可能需要通过协商或谈判来确定。例如，如果采购项目比较复杂或代理服务内容较多，那么代理费用可能会相应增加，此时就需要通过协商来确定具体的承担方式。
建议：
- 在参与政府采购活动时，应仔细阅读并理解采购文件及合同条款，明确代理费用的承担方式。
- 如遇代理费用承担问题存在争议，应及时与采购人、采购代理机构或相关部门进行沟通协商，以寻求合理的解决方案。
综上所述，政府采购限额以上代理费的承担主体并不是固定的，而是需要根据具体情况来确定。因此，在参与政府采购活动时，应密切关注相关合同约定和法律法规的变化，以确保自身权益得到保障。