劳动合同没有写明薪资结构，另外写一个薪资确认表写绩效是有效的。但为了确保其法律效力，需要满足一定的条件。

首先，从法律角度来看，《劳动合同法》并未明确规定薪资结构必须写在劳动合同中，但要求劳动合同中应包含劳动报酬等条款。如果劳动合同中未明确薪资结构，但双方通过薪资确认表等形式对绩效进行了明确，且该确认表是双方真实意思的表示，不违反法律、行政法规的强制性规定，那么该薪资确认表应被视为劳动合同的有效补充，对双方具有约束力。

其次，为了确保薪资确认表的有效性，建议注意以下几点：

1. 双方签字确认：薪资确认表应由用人单位和劳动者双方签字或盖章确认，以表明双方对表中内容的认可。
2. 内容明确具体：薪资确认表中应明确绩效的计算方法、标准、发放时间等关键信息，避免模糊不清导致后续争议。
3. 与劳动合同相互补充：虽然薪资结构未在劳动合同中明确，但薪资确认表应作为劳动合同的补充文件，与劳动合同具有同等法律效力。
4. 留存证据：双方应妥善保管薪资确认表的原件或复印件，以便在发生争议时作为证据使用。

综上所述，劳动合同没有写明薪资结构时，另外写一个薪资确认表写绩效是有效的。但为了确保其法律效力，双方应签字确认、内容明确具体，并作为劳动合同的补充文件留存证据。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。