当施工单位对结算审核单位提出的结算结果有异议时，可以通过一系列步骤来合理、有效地处理这种异议。以下是一个详细且具深度的解答流程：

一、初步核对与内部审查

1. 仔细核对结算单内容：

   • 施工单位应首先仔细核对结算单中的各项内容，包括工程量、单价、费用构成等，确保数据的准确性和合理性。
   • 对比合同条款，检查结算单是否符合合同约定的结算方式和标准。

2. 内部审查与讨论：

   • 施工单位内部应组织相关专业人员进行审查，分析结算单中可能存在的问题和争议点。
   • 形成初步意见，并准备相关证据和资料以支持异议。

二、与结算审核单位沟通

1. 书面提出异议：

   • 施工单位应以书面形式向结算审核单位提出异议，明确列出争议点、理由及建议的修改方案。
   • 附上相关证据和资料，如施工记录、合同条款、图纸等，以支持异议。

2. 请求详细解释：

   • 要求结算审核单位对争议点进行详细解释，说明其结算依据和理由。
   • 通过沟通了解双方的分歧所在，为后续的协商或调解打下基础。

三、寻求第三方意见或调解

1. 咨询专家意见：

   • 施工单位可以寻求行业专家或咨询机构的意见，对争议点进行专业评估。
   • 专家意见可以作为协商或调解的依据，增强施工单位的谈判地位。

2. 申请调解：

   • 如果双方无法直接沟通解决争议，可以向相关行业协会或政府主管部门申请调解。
   • 调解过程中，双方应积极配合，寻求妥善的解决方案。

四、法律途径解决

1. 准备法律文件：

   • 如果调解无果，施工单位应准备相关法律文件，如起诉状、证据清单等。
   • 咨询专业律师，了解诉讼程序和可能的结果。

2. 提起诉讼或仲裁：

   • 根据合同约定或法律规定，施工单位可以向人民法院提起诉讼或申请仲裁。
   • 在诉讼或仲裁过程中，施工单位应充分举证证明自己的主张，积极参与庭审或仲裁程序。

五、注意事项

1. 保持冷静与理性：

   • 在处理异议过程中，施工单位应保持冷静与理性，避免采取过激行为。
   • 通过合法途径维护自身权益，避免引发不必要的法律纠纷。

2. 关注时效问题：

   • 施工单位应关注相关的诉讼时效或仲裁时效问题，确保在规定期限内提起诉讼或申请仲裁。
   • 避免因超过时效而丧失法律保护。

3. 保留证据与记录：

   • 在整个处理过程中，施工单位应保留所有相关证据和记录。
   • 这些证据和记录对于后续的法律程序或协商调解都具有重要意义。

综上所述，当施工单位对结算审核单位有异议时，应通过初步核对与内部审查、与结算审核单位沟通、寻求第三方意见或调解以及法律途径解决等步骤来合理、有效地处理异议。同时，保持冷静与理性、关注时效问题以及保留证据与记录也是处理异议过程中需要注意的重要事项。