公司办理入职后不会返还毕业证，因为正规的公司或机构在入职时是不会要求员工提交毕业证原件的，只会要求员工出示毕业证以进行信息核对，或者要求提供毕业证的复印件或影印件，并在合适位置注明具体用途。

“扣证件”是指用人单位或中介机构借保管或经办社会保险、申办工资卡等业务名义，扣押求职者身份证、毕业证、学位证等个人证件原件，这是典型的求职陷阱。根据劳动合同法的规定，用人单位招用劳动者时，不得扣押劳动者的居民身份证和其他证件，也不得要求劳动者提供担保或者以其他名义向劳动者收取财物。

因此，如果遇到有公司要求提交毕业证原件作为入职条件，应该果断拒绝，并向劳动监察部门举报。同时，在求职过程中，也要提高警惕，注意保护自己的合法权益，避免掉入各种求职陷阱。