员工病假三个月后，单位一般不可以开除员工，但这并非绝对，需根据具体情况来判断。

首先，我们要明确的是，员工在病假期间，特别是处于法定医疗期内时，享有特殊的法律保护。根据《中华人民共和国劳动法》及《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动者患病或者非因工负伤，在规定的医疗期内，用人单位不得依据无过失性辞退或经济性裁员的规定解除劳动合同。医疗期的时长依据劳动者的实际工作年限和在本单位的工作年限来确定，从病休第一天开始累计计算。

如果员工病假三个月仍处于其法定医疗期内，那么单位开除员工将属于违法解除劳动合同。在这种情况下，员工有权要求单位继续履行劳动合同，或者要求单位按照经济补偿标准的二倍支付赔偿金。赔偿金的计算方式为：按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。

然而，也存在一些特殊情况。如果员工在病假期间存在严重违反公司规章制度的行为，如提供虚假病假证明、未经批准擅自离开就医地等，或者在入职时隐瞒重大疾病史导致单位错误录用，又或者被依法追究刑事责任等，单位在有充分证据的情况下，可以依据《劳动合同法》第三十九条的相关规定解除劳动合同，且无需支付赔偿。

综上所述，员工病假三个月后单位是否可以开除员工，并非一个简单的“可以”或“不可以”的问题，而是需要根据员工的具体病假情况、医疗期以及是否存在特殊情形等因素来综合判断。如果你或你身边的人遇到了类似的问题，建议尽快咨询专业律师以获取更准确的法律意见和帮助。