针对您提出的问题“运管部门查汽修厂，有营业执照和房屋租赁合同，算合法吗”，我可以给出以下分析：

结论前置：汽修厂拥有营业执照和房屋租赁合同，并不意味着其在所有方面都完全合法，但至少在经营资质和场地使用方面是符合基本要求的。然而，是否完全合法还需考虑其他因素，如是否遵守了相关行政法规、环保要求、消防安全等。

详细分析：

1. 营业执照：营业执照是企业合法经营的凭证，表明汽修厂已经通过了工商部门的注册登记，具备了基本的经营资质。因此，从经营资质的角度来看，汽修厂是合法的。

2. 房屋租赁合同：房屋租赁合同是汽修厂使用场地的法律依据。如果合同内容合法、有效，且汽修厂按照合同约定使用房屋，那么在场地使用方面也是合法的。

3. 其他合规要求：除了营业执照和房屋租赁合同外，汽修厂还需要遵守其他相关法规，如环保法规、消防法规、安全生产法规等。例如，汽修厂需要确保废弃物的合规处理，防止环境污染；需要确保消防安全设施的完善，防止火灾事故的发生；需要确保员工的安全生产培训，防止生产安全事故的发生。

因此，虽然汽修厂拥有营业执照和房屋租赁合同，但并不能完全保证其在所有方面都合法。运管部门在检查时，除了查看营业执照和房屋租赁合同外，还会对汽修厂的其他方面进行全面的检查，以确保其完全符合法律法规的要求。

总结：汽修厂拥有营业执照和房屋租赁合同是合法经营的基本条件之一，但并非完全合法的充分条件。为了确保汽修厂的完全合法，还需要遵守其他相关法规，并接受运管部门的全面检查。如果您在经营汽修厂过程中遇到任何法律问题，欢迎随时向我咨询。