三方协议约定付款人和受票人不一致，并不必然导致协议无效。具体分析如下：
在合同法领域，一个协议的有效性主要取决于协议的内容是否违反法律法规的强制性规定，以及协议是否系各方当事人的真实意思表示。对于三方协议中付款人和受票人不一致的情况，这并不直接构成协议无效的理由。
合同自由原则：根据合同法的基本原则，合同是当事人之间设立、变更、终止民事关系的协议。只要合同的内容不违反法律法规的强制性规定，且系各方当事人的真实意思表示，那么合同就是有效的。因此，付款人和受票人不一致并不违反合同自由原则。
合同内容的约定：在三方协议中，付款人和受票人的不一致可能是基于特定的商业安排或交易需求。只要这种安排或需求在协议中得到了明确约定，且各方当事人都对此表示同意，那么这种约定就是有效的。
法律后果：然而，需要注意的是，付款人和受票人不一致可能会给合同的履行带来一定的复杂性和风险。例如，在税务处理上可能会引发一些特殊的问题，或者在合同履行过程中出现纠纷时，可能会增加解决纠纷的难度。因此，在签订三方协议时，各方应当充分考虑到这些因素，并在协议中作出相应的约定和安排。
综上所述，三方协议约定付款人和受票人不一致并不必然导致协议无效。关键在于协议的内容是否违反法律法规的强制性规定，以及是否系各方当事人的真实意思表示。如果你在实际操作中遇到此类问题，建议详细咨询专业律师，以确保你的权益得到充分保护。当然，你也可以直接向我咨询，我在合同纠纷领域有着丰富的经验和专业的知识。