针对您提出的“跟厂里签了买断协议后续查处员工有违纪行为合同还有效嘛”这一问题，我首先明确回答：买断协议后续的效力，在员工被查处有违纪行为的情况下，并非一成不变，而是需要根据具体情况及协议条款来判断。

1. 协议条款的审查：

   • 首先，要仔细审查买断协议中的具体条款，特别是关于合同终止、违约责任以及违纪行为处理等方面的约定。
   • 如果协议中明确规定了员工违纪行为将导致合同无效或解除，那么一旦员工被查处有违纪行为，厂方有权依据协议条款主张合同无效或解除。

2. 违纪行为的性质与严重性：

   • 违纪行为的性质与严重性也是判断合同是否有效的重要因素。
   • 如果员工的违纪行为严重违反了厂规厂纪或法律法规，且对厂方造成了重大损失或影响，那么即使协议中没有明确规定，厂方也可能有权主张合同无效或解除。

3. 法律法规的约束：

   • 在处理此类问题时，还需考虑法律法规的约束。
   • 如果员工的违纪行为涉及违法犯罪，那么合同的效力将受到法律法规的严格限制，厂方可能需依法追究员工的法律责任，并依据法律法规的规定处理合同问题。

4. 综合判断与协商：

   • 在具体情况下，还需要综合考虑买断协议的签订背景、目的以及双方当事人的真实意图等因素。
   • 如果双方对合同的效力存在争议，建议通过协商或法律途径解决，以确保双方的合法权益得到妥善保护。

综上所述，买断协议在员工被查处有违纪行为后的效力问题，需要根据具体情况及协议条款来判断。如果您对此类问题存在疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询，我将竭诚为您提供专业的法律意见和服务。