针对“施工单位未经变更进行施工怎么处罚”的问题，以下是我给出的详细解答：
首先，需要明确的是，施工单位在未经变更的情况下擅自进行施工，是违反了相关法律法规的行为。具体来说，这种行为可能违反了《建设工程质量管理条例》以及相关的施工图设计文件审查管理办法等规定。
根据相关法律法规，对于此类违法行为，通常会采取以下处罚措施：
责令改正：相关执法部门会首先责令施工单位立即停止违法行为，并按照要求进行整改，以确保施工活动符合法律法规的要求。
罚款：施工单位因未经变更擅自施工，可能会面临一定数额的罚款。罚款的具体金额会根据违法行为的严重程度、造成的后果以及相关法律法规的规定来确定。例如，在某些情况下，罚款金额可能高达工程合同价款的1%以上2%以下，或者更高。
对责任人员的处罚：除了对施工单位进行处罚外，相关执法部门还会对直接负责的主管人员和其他直接责任人员进行处罚。这通常包括罚款、警告等行政处罚措施。
其他处罚措施：在严重的情况下，施工单位可能会面临更严厉的处罚措施，如吊销施工许可证、停业整顿等。这些措施旨在确保施工单位能够严格遵守法律法规，保障建筑工程的质量和安全。
综上所述，施工单位未经变更进行施工是违法行为，将面临责令改正、罚款、对责任人员的处罚以及其他可能的处罚措施。因此，建议施工单位在施工前务必按照相关法律法规的要求进行变更申请和审查，确保施工活动的合法性和合规性。