代理公司在收取了代理服务费后，一般不应再额外收取专家评审费和清单编制费。以下是对这一结论的详细解释：

1. 合同约定原则：

   • 代理公司与委托方之间的服务内容和费用，通常应在双方签订的代理服务合同中明确约定。
   • 如果合同中已经包含了专家评审费和清单编制费，则代理公司有权按照合同约定收取这些费用。
   • 但如果合同中未明确约定这些费用，或者已经通过代理服务费涵盖了所有服务内容，那么代理公司就不应再额外收取。

2. 费用合理性原则：

   • 代理服务费本身应当包含代理公司提供的所有服务成本，包括但不限于专家评审、清单编制等。
   • 如果代理公司在收取了代理服务费后，仍然要求额外收取专家评审费和清单编制费，这可能构成重复收费，违反了费用合理性原则。

3. 行业惯例与法律法规：

   • 在招标代理等行业中，通常不会将专家评审费和清单编制费作为单独的项目来收取，而是将其纳入代理服务费中。
   • 同时，相关法律法规也并未规定代理公司可以额外收取这些费用。

综上所述，代理公司在收取了代理服务费后，一般不应再额外收取专家评审费和清单编制费。如果代理公司坚持要求额外收取这些费用，建议委托方仔细审查代理服务合同，并与代理公司进行协商，以确保自身权益不受损害。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。