当被告公司的法定代表人已被涤除，但在起诉状中仍需要指明其法定代表人时，你可以按照以下方式撰写起诉状中的相关部分：

一、基本情况描述

首先，在起诉状的开头部分，简要描述被告公司的基本情况，包括公司名称、住所地、统一社会信用代码等。接着，明确指出被告公司原法定代表人已被涤除的情况，例如：“被告公司原法定代表人XXX（姓名）已因XXX原因（如离职、辞职、被解聘等）被涤除，但公司尚未完成法定代表人的变更登记。”

二、法定代表人信息的填写

1. 若已知新法定代表人信息：

   • 如果被告公司已经任命了新的法定代表人，并且该信息已经或应当为原告所知，那么在起诉状中应直接写明新法定代表人的姓名、职务等信息。例如：“现被告公司的法定代表人为XXX（新法定代表人姓名），职务为XXX。”

2. 若未知新法定代表人信息：

   • 如果被告公司尚未任命新的法定代表人，或者原告无法获知新法定代表人的信息，那么在起诉状中可以表述为：“被告公司目前尚未完成法定代表人的变更登记，无明确的新法定代表人。”

三、诉讼请求与事实理由

在诉讼请求部分，根据你的具体诉求来阐述，例如要求确认某事项、请求赔偿等。在事实理由部分，详细陈述导致你提起诉讼的具体事实，包括与原法定代表人相关的事实（如其行为或决策对你造成的影响），以及你为何选择起诉被告公司而非原法定代表人个人。

四、法律依据

在起诉状的最后部分，列出你提起诉讼的法律依据，如《中华人民共和国公司法》的相关条款，以及其他可能适用的法律法规。

五、注意事项

• 准确性：确保起诉状中填写的所有信息都是准确无误的，特别是公司名称、法定代表人姓名等关键信息。
• 清晰性：起诉状的表述应清晰明了，避免使用模糊或含糊不清的措辞。
• 逻辑性：起诉状的内容应具有逻辑性，按照事实发生的时间顺序或逻辑关系进行组织。

综上所述，当被告公司的法定代表人已被涤除时，在起诉状中应根据实际情况填写法定代表人的信息，并清晰、准确地阐述你的诉讼请求和事实理由。如果无法确定新的法定代表人，应明确说明这一情况。