干部退休时个人档案与干部履历不符，应首先由单位组织人事部门进行调查核实，并依据核实结果按照相关规定进行处理。具体分析如下：
一. 调查核实
- 启动调查：一旦发现个人档案与干部履历存在不符的情况，单位组织人事部门应立即启动调查程序，对相关信息进行核实。
- 核实方式：可以通过查阅原始资料、询问相关证人、与本人核实等方式进行。
- 形成结论：调查结束后，应形成书面调查报告，明确不符的具体内容、原因及责任归属。
二. 处理规定
- 根据核实结果处理：
- 如若核实结果为个人填写错误或信息更新不及时等非故意行为导致的，单位可要求个人进行更正，并按照规定程序对档案进行修正。
- 如若核实结果为故意篡改、伪造等违规行为导致的，单位应依据相关规定对责任人进行严肃处理，包括但不限于纪律处分、取消相关待遇等。
- 涉及退休待遇的处理：
- 若个人档案与干部履历的不符影响了退休待遇的核定，单位应依据核实后的信息重新核定退休待遇，并按照规定程序进行补发或扣减。
三. 后续管理
- 加强档案管理：单位应加强对个人档案的管理，建立健全档案管理制度，确保档案的完整、准确和及时更新。
- 加强教育培训：单位应加强对干部的教育培训，提高干部对档案重要性的认识，增强干部的档案意识和法律意识。
我建议，在处理此类问题时，单位应秉持公正、客观、严谨的态度，确保调查核实的准确性和公正性。同时，个人也应积极配合单位的调查工作，如实提供相关信息和资料。如有进一步需要，您可以继续咨询我。