在两家公司任职，个人所得税的减除费用（即起征点）仍然是每月5000元，但具体计算方式需根据两家公司发放工资的情况来确定。以下是详细分析：

一. 个人所得税减除费用的规定

• 根据《中华人民共和国个人所得税法》第六条，居民个人的综合所得，以每一纳税年度的收入额减除费用六万元以及专项扣除、专项附加扣除和依法确定的其他扣除后的余额，为应纳税所得额。这里的“费用六万元”即指的是每年的减除费用，折算到每月就是5000元。

二. 在两家公司任职的个税计算

1. 工资发放情况：

    - 如果两家公司分别发放工资，且各自都按照5000元作为起征点进行税前扣除，那么在实际汇算清缴时，个人需要将两处取得的工资薪金所得合并，按照全年六万元的减除费用标准进行扣除，多退少补。
    - 需要注意的是，这并不意味着在两家公司都可以分别享受5000元的免税额，而是合并后总收入只享受一次5000元/月的免税额。
   

2. 个税预扣预缴：

    - 每家公司在进行个税预扣预缴时，会按照本公司发放的工资额和相应的税率进行扣缴。但由于不知道个人在其他公司还有收入，所以可能会存在预扣预缴税额不准确的情况。
   

3. 年度汇算清缴：

    - 到了年度终了，个人需要自行或者通过雇主、税务机关等渠道进行汇算清缴。此时，应将两处取得的工资薪金所得合并，按照全年六万元的减除费用标准进行扣除，并计算应纳个人所得税税额。如果预扣预缴的税额多于应纳税额，税务机关会退还多缴的税款；如果预扣预缴的税额少于应纳税额，个人需要补缴税款。
   

我建议：在两家公司任职的个人，应关注自己的工资发放和个税扣缴情况，确保在年度汇算清缴时能够准确计算应纳个人所得税税额。同时，也可以咨询税务机关或专业税务机构，以获取更详细的个税计算和缴纳指导。如有进一步需要，您可以继续咨询我。