两处以上工资薪金所得减除费用时，基本减除费用（即起征点）六万元以及专项扣除、专项附加扣除等只能选择在其中一处扣除，另一处则不能再次扣除。具体分析如下：
一. 两处以上工资薪金所得减除费用的原则
- 根据《中华人民共和国个人所得税法实施条例》第二十八条，居民个人取得工资、薪金所得时，可以向扣缴义务人提供专项附加扣除有关信息，由扣缴义务人扣缴税款时减除专项附加扣除。纳税人同时从两处以上取得工资、薪金所得，并由扣缴义务人减除专项附加扣除的，对同一专项附加扣除项目，在一个纳税年度内只能选择从一处取得的所得中减除。
二. 具体减除项目
- 基本减除费用：根据《中华人民共和国个人所得税法》第六条，居民个人的综合所得，以每一纳税年度的收入额减除费用六万元后的余额，为应纳税所得额。这是基本减除费用，也即起征点。
- 专项扣除：包括居民个人按照国家规定的范围和标准缴纳的基本养老保险、基本医疗保险、失业保险等社会保险费和住房公积金等。
- 专项附加扣除：包括子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息或者住房租金、赡养老人等支出。
三. 汇算清缴
- 如果纳税人从两处以上取得综合所得，且综合所得年收入额减除专项扣除的余额超过6万元，或者存在其他需要办理汇算清缴的情形（如预缴税额低于应纳税额、申请退税等），则需要在次年的3月1日至6月30日内进行汇算清缴，根据全年综合所得情况重新计算应纳税额，并多退少补。
综上所述，两处以上工资薪金所得在减除费用时，需要注意基本减除费用、专项扣除和专项附加扣除等只能选择在其中一处扣除。如果有多处所得，建议在汇算清缴时仔细核对，确保正确申报和缴纳税款。如有进一步需要，您可以继续咨询我。