单位对在厂区骑电动车没开大灯的行为罚款3千是不合理的。下面我将从法律角度对此进行详细分析：

一. 单位无权设定罚款

1. 法律依据：根据《中华人民共和国行政处罚法》的相关规定，行政处罚由具有行政处罚权的行政机关在法定职权范围内实施。单位作为非行政机关，并不具备设定和实施罚款的权力。
2. 实例说明：例如，交通警察有权对违反交通规则的行为进行罚款，但企业单位并不能因为员工在厂区内未开大灯就对其罚款。

二. 罚款金额过高且缺乏法律依据

1. 法律依据：在我国，罚款作为一种行政处罚，其金额和适用范围都有严格的法律规定。单位自行设定的3千元罚款，既缺乏法律依据，也显然过高，不符合行政处罚的公正性和合理性原则。
2. 实例说明：通常，对于类似的轻微违规行为，如未开大灯，即使是由有权机关进行处罚，其金额也往往较低，且会明确列出在相关的法律法规中。

三. 单位应采取其他合理措施

1. 建议措施：单位为了保障厂区内的交通安全，可以通过制定内部规章制度，要求员工在骑电动车时开启大灯，并通过宣传教育、提醒警告等方式来促使员工遵守。对于多次违规的员工，单位可以采取如通报批评、扣减绩效奖金等合理的内部管理措施，而非直接罚款。
2. 法律依据：根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，用人单位有权制定劳动纪律和规章制度，但这些制度应当合法、合理，并不得侵犯劳动者的合法权益。

综上所述，单位对在厂区骑电动车没开大灯的行为罚款3千是不合理的。我建议你可以与单位进行沟通，指出其罚款行为的违法性，并要求单位采取合理、合法的内部管理措施。如有进一步需要，您可以继续咨询我。